Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knop1Q9Z2Q2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms