Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl3Q9Z2M6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms