Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod3Q9R0E1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms