Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lsm4Q9QXA5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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