Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC4BQ9NT99 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms