Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Col5a3Q9JLI2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Col5a3Q9JLI2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms