Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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Bco1Q9JJS6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bco1Q9JJS6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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