Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc46a3Q9DC26 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms