Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms