Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim3Q99PE5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms