Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcl3Q8BVF2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms