Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC62Q6P9F0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms