Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NipblQ6KCD5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NipblQ6KCD5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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