Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg9aQ68FE2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg9aQ68FE2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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