Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ptpn13Q64512 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ptpn13Q64512 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ptpn13Q64512 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ptpn13Q64512 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ptpn13Q64512 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ptpn13Q64512 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ptpn13Q64512 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn13Q64512 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ptpn13Q64512 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ptpn13Q64512 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ptpn13Q64512 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ptpn13Q64512 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn13Q64512 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ptpn13Q64512 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms