Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms