Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WhammQ571B6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WhammQ571B6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WhammQ571B6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
WhammQ571B6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WhammQ571B6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WhammQ571B6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WhammQ571B6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WhammQ571B6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WhammQ571B6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WhammQ571B6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms