Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Ulk3Q3U3Q1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk3Q3U3Q1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ulk3Q3U3Q1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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