Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TchpQ3TVW5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TchpQ3TVW5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TchpQ3TVW5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TchpQ3TVW5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms