Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YMR221CYMR221C 1515 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 HXT14YNL318C 1623 nt6.14□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 IRC4YDR540C 540 nt6.13□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 RPL30YGL030W 318 nt6.13□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 MSL1YIR009W 336 nt6.13□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 RHO2YNL090W 579 nt6.13□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 GDT1YBR187W 843 nt6.13□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 BZZ1YHR114W 1902 nt6.13□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YAP1801YHR161C 1914 nt6.13□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 RGP1YDR137W 1992 nt6.13□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 MTC5YDR128W 3447 nt6.12□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 SLX8YER116C 825 nt6.12□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 RPS25AYGR027C 327 nt6.12□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YLR230WYLR230W 306 nt6.12□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YAR075WYAR075W 474 nt6.12□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 MKK2YPL140C 1521 nt6.12□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 UBX7YBR273C 1311 nt6.12□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 BUL1YMR275C 2931 nt6.12□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 IOC4YMR044W 1428 nt6.11□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 TIF35YDR429C 825 nt6.11□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt6.11□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 TCD1YHR003C 1290 nt6.11□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 TIP20YGL145W 2106 nt6.11□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 STE13YOR219C 2796 nt6.11□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 snR62snR62 100 nt6.1□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 RIM9YMR063W 720 nt6.1□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 DAL82YNL314W 768 nt6.1□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 RDL2YOR286W 450 nt6.1□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YPL229WYPL229W 621 nt6.1□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 snR3snR3 194 nt6.1□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 MDM36YPR083W 1740 nt6.09□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YDR053WYDR053W 396 nt6.09□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 YGR176WYGR176W 348 nt6.09□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 PAI3YMR174C 207 nt6.09□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 RPS10AYOR293W 318 nt6.09□□□□□ -1.43
NCR1Q12200 CEX1YOR112W 2286 nt6.08□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YDL062WYDL062W 426 nt6.08□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 RTR2YDR066C 591 nt6.08□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.08□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt6.08□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 RPB10YOR210W 213 nt6.08□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 PDX3YBR035C 687 nt6.08□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 NAT3YPR131C 588 nt6.08□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 TEA1YOR337W 2280 nt6.08□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 SHS1YDL225W 1656 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YDL034WYDL034W 345 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 AAD4YDL243C 990 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 COX26YDR119W-A 201 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YGL088WYGL088W 366 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 GON7YJL184W 372 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 PNP1YLR209C 936 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 RPL6BYLR448W 531 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 TRM112YNR046W 408 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 CUL3YGR003W 2235 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 SHE10YGL228W 1734 nt6.07□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YLL007CYLL007C 1998 nt6.06□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 PMS1YNL082W 2622 nt6.06□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 snR55snR55 98 nt6.06□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 MRP10YDL045W-A 288 nt6.06□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 COX9YDL067C 180 nt6.06□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 HMF1YER057C 390 nt6.06□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt6.06□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YNG1YOR064C 660 nt6.06□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 QDR3YBR043C 2070 nt6.06□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 TNA1YGR260W 1605 nt6.06□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 MKT1YNL085W 2493 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 snR59snR59 78 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 GLO2YDR272W 825 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 OTU1YFL044C 906 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 PAM18YLR008C 507 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 HTA2YBL003C 399 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 PGA3YML125C 939 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 TMC1YOR052C 453 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YAR1YPL239W 603 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 HXT4YHR092C 1731 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 MRC1YCL061C 3291 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 SPC72YAL047C 1869 nt6.05□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YIL067CYIL067C 2037 nt6.04□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 CDC5YMR001C 2118 nt6.04□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 GUF1YLR289W 1938 nt6.04□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 GRX4YER174C 735 nt6.04□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt6.04□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 SDA1YGR245C 2304 nt6.04□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 MKK1YOR231W 1527 nt6.04□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YEL020CYEL020C 1683 nt6.04□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 VNX1YNL321W 2727 nt6.04□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YME1YPR024W 2244 nt6.03□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 UBA2YDR390C 1911 nt6.03□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 FMP25YLR077W 1752 nt6.03□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 ZPR1YGR211W 1461 nt6.03□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 VPS70YJR126C 2436 nt6.03□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 HTL1YCR020W-B 237 nt6.03□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YGL165CYGL165C 579 nt6.03□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 MTC3YGL226W 372 nt6.03□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 YBR016WYBR016W 387 nt6.03□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 SHE4YOR035C 2370 nt6.03□□□□□ -1.44
NCR1Q12200 DSS1YMR287C 2910 nt6.03□□□□□ -1.44
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