Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 RPN2YIL075C 2838 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 BEM4YPL161C 1902 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 ERP3YDL018C 678 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 MGT1YDL200C 567 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 THO1YER063W 657 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 AST2YER101C 1293 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 SEC4YFL005W 648 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 VMA5YKL080W 1179 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 SEC14YMR079W 915 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 RPL13BYMR142C 600 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 VAM10YOR068C 345 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 RFC5YBR087W 1065 nt3.37□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 RIF1YBR275C 5751 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 VBA4YDR119W 2307 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 SPO14YKR031C 5052 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 DBP10YDL031W 2988 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 RPL13AYDL082W 600 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 PEF1YGR058W 1008 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 YGR073CYGR073C 372 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 RPS23AYGR118W 438 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 QCR10YHR001W-A 234 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 CTK2YJL006C 972 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 HHF2YNL030W 312 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 YNL184CYNL184C 327 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 HUA2YOR284W 732 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 YOR385WYOR385W 873 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 RPS23BYPR132W 438 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 PIG2YIL045W 1617 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 POL2YNL262W 6669 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 UBP14YBR058C 2346 nt3.36□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 ATG13YPR185W 2217 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 YPD1YDL235C 504 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 BMH2YDR099W 822 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 RRT13YER066W 558 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 MAM1YER106W 909 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 CWC23YGL128C 852 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 YGR017WYGR017W 894 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 RPC25YKL144C 639 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 SMD2YLR275W 333 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 RSM19YNR037C 276 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 TSR4YOL022C 1227 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 YOL114CYOL114C 609 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 TUM1YOR251C 915 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 ESA1YOR244W 1338 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 YJR030CYJR030C 2238 nt3.35□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 ATC1YDR184C 885 nt3.34□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 MBB1YJL199C 327 nt3.34□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 GPX1YKL026C 504 nt3.34□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 KAR4YCL055W 1008 nt3.34□□□□□ -1.87
RIM20Q12033 SRP68YPL243W 1800 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 SEC15YGL233W 2733 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 NRG1YDR043C 696 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 IKI1YHR187W 930 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 COA4YLR218C 453 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 RPN13YLR421C 471 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 RPL6BYLR448W 531 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 LTP1YPR073C 486 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 SCD6YPR129W 1050 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 TRM82YDR165W 1335 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YJL049WYJL049W 1353 nt3.33□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 ITC1YGL133W 3795 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 PEX10YDR265W 1014 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 AIM11YER093C-A 414 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 SMX2YFL017W-A 234 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YFH7YFR007W 1062 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YJL114WYJL114W 681 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 FAR3YMR052W 615 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 RPS7AYOR096W 573 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 CAT5YOR125C 702 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YBP2YGL060W 1926 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 NDC80YIL144W 2076 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 SEA4YBL104C 3117 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 STT4YLR305C 5703 nt3.32□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 DIG2YDR480W 972 nt3.31□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YGL214WYGL214W 486 nt3.31□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 TPT1YOL102C 693 nt3.31□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 RPL33AYPL143W 324 nt3.31□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 CIN2YPL241C 807 nt3.31□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YBR090CYBR090C 369 nt3.31□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 TFC4YGR047C 3078 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 CEP3YMR168C 1827 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 REG1YDR028C 3045 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YNL011CYNL011C 1335 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 ERP6YGL002W 651 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 GTR2YGR163W 1026 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 PHD1YKL043W 1101 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 MRP8YKL142W 660 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 COX14YML129C 213 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 GRX5YPL059W 453 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 HFM1YGL251C 3564 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 POL4YCR014C 1749 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 MDM36YPR083W 1740 nt3.3□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 RPN1YHR027C 2982 nt3.29□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YDL242WYDL242W 354 nt3.29□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 DLS1YJL065C 504 nt3.29□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 AIM25YJR100C 984 nt3.29□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 INO4YOL108C 456 nt3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.4 ms