Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psme1P97371 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psme1P97371 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psme1P97371 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psme1P97371 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psme1P97371 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme1P97371 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psme1P97371 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms