Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2mP61082 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2mP61082 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms