Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CratP47934 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CratP47934 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CratP47934 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CratP47934 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CratP47934 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CratP47934 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CratP47934 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CratP47934 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CratP47934 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CratP47934 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CratP47934 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CratP47934 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CratP47934 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CratP47934 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CratP47934 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CratP47934 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CratP47934 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CratP47934 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms