Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTNP21246 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTNP21246 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTNP21246 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTNP21246 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTNP21246 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTNP21246 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTNP21246 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTNP21246 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms