Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spi1P17433 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spi1P17433 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spi1P17433 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spi1P17433 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms