Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
KDM4AO75164 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms