Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vamp4O70480 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms