Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2f6O54917 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f6O54917 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms