Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf5O35326 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms