Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad7O35253 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms