Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20425E9Q035 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms