Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hacd4A2AKM2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hacd4A2AKM2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms