Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Knop1Q9Z2Q2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Knop1Q9Z2Q2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms