Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl3Q9Z2M6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms