Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SETD1BQ9UPS6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SETD1BQ9UPS6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms