Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Plod3Q9R0E1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod3Q9R0E1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 521.3 ms