Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnckQ9QYK9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnckQ9QYK9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms