Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lsm4Q9QXA5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lsm4Q9QXA5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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