Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC4BQ9NT99 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC4BQ9NT99 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC4BQ9NT99 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms