Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bco1Q9JJS6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bco1Q9JJS6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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