Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc46a3Q9DC26 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc46a3Q9DC26 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms