Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ergic1Q9DC16 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic1Q9DC16 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic1Q9DC16 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic1Q9DC16 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic1Q9DC16 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic1Q9DC16 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ergic1Q9DC16 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms