Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atad1Q9D5T0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atad1Q9D5T0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms