Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933402E13RikQ9D4D2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms