Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GORASP1Q9BQQ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GORASP1Q9BQQ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GORASP1Q9BQQ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 426.7 ms