Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smg8Q8VE18 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg8Q8VE18 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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