Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrit1Q8K099 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms