Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Lrif1Q8CDD9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrif1Q8CDD9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrif1Q8CDD9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrif1Q8CDD9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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Lrif1Q8CDD9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrif1Q8CDD9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrif1Q8CDD9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrif1Q8CDD9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Lrif1Q8CDD9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Lrif1Q8CDD9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrif1Q8CDD9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrif1Q8CDD9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Lrif1Q8CDD9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Lrif1Q8CDD9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Lrif1Q8CDD9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Lrif1Q8CDD9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Lrif1Q8CDD9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Lrif1Q8CDD9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Lrif1Q8CDD9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Lrif1Q8CDD9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Lrif1Q8CDD9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrif1Q8CDD9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms