Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc30Q8BVF4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc30Q8BVF4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc30Q8BVF4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms